侦查系始建于1985年，是吉林警院成立最早的系部之一。经过30余年的发展建设，侦查系在教师队伍建设、学科建设、教材建设和教学质量等方面都取得了长足的进步和丰硕的成果。侦查系主要负责侦查学专业的教学和科学研究工作，目前开设有侦查学本科专业和刑事侦查专科专业。侦查学专业致力于培养政治可靠、作风优良、专业过硬、身心健康，具有良好的职业素养和人文社会科学素养，系统掌握侦查学专业基本理论、基本知识和基本技能，熟悉相关法律、法规，具备侦查人员职业核心能力和创新精神，能够在公安机关从事刑事侦查等工作或在其他政法机关从事相关工作的应用型高级专门人才。目前，侦查系已培养三届本科毕业生共计391人。

侦查系下设侦查学基础理论教研室、刑事侦查教研室、技术侦查教研室、犯罪学和预审学教研室、国内安全保卫教研室、刑事情报与反恐怖教研室6个教研室。其中，侦查学基础理论教研室开设《侦查学总论》、《刑事侦查学通论》、《公安机关办理刑事案件程序规定》、《侦查学原理》、《侦查史》等课程；刑事侦查教研室开设《犯罪现场勘查》、《刑事案件侦查》、《侦查措施》、《缉毒》、《刑侦实战技能综合训练》课程；技术侦查教研室开设《网络犯罪侦查》、《视频侦查》、《侦查技战法》等课程；犯罪学和预审学教研室开设《预审学》、《侦查讯问》、《测谎技术》、《刑事侦查文书制作》等课程；刑事情报与反恐怖教研室《公安情报学概论》开设《公安情报收集》、《公安情报分析》、《公安情报管理》、《公安情报整编》等课程。

侦查系主要职责包括：制定本系教学、科研工作发展规划并组织实施；组织开展本系相关学科建设、专业建设和课程建设；制定并组织实施本系开设专业的教学计划；日常教学管理；制定并落实本系师资队伍建设规划，负责本系教师的聘用、考核、进修培训、日常教育和管理；组织教研、科研课题的申报、研究；开展多种形式的学术活动，提高科学研究水平；组织本系学生考试、考核，做好成绩管理工作；配合本系学生管理大队加强学生思想政治工作；协助做好毕业生推荐工作；学院交办的其它工作。

侦查系现有一支老中青相结合，具有较高政治素质和学术素养的专业教师队伍。现拥有1名吉林省教学名师， 1名吉林省教学新秀，1名院级学科带头人，1名专业带头人。2011年，侦查系列课程团队被评为吉林省高等学校优秀教学团队，2013侦查实战技能综合训练团队被评为吉林省高等学校优秀教学团队。

侦查学专业课程设置与公安机关刑事侦查实践紧密联系。2000年侦查专业在全国公安院校中率先开设了“刑事侦查实战技能综合训练”课程，为深化侦查专业教学改革和“教、学、练、战”一体化教学模式的形成积累了宝贵经验。目前， 侦查学专业建设了1门省级精品课、3门院级精品课、3门院级优秀课。2016年侦查系组织编写出版了3本学院实验实训规划教材《侦查实战技能综合实训教程》、《犯罪现场勘查实训教程》、《预审实训教程》。形成基础扎实、实力雄厚的课程体系。

多年来，在学院的大力支持下，全系教师积极进取，开拓创新，在教育教学改革、人才培养、专业建设、课程建设等工作中取得了突出成绩。2005年侦查专业被确定为吉林省高职高专教育教学改革示范专业；侦查学专业2011年被确定为吉林省“十二五”特色专业建设点，2014年被确定为吉林省高等学校品牌专业建设点，2015年被确定为公安部重点专业建设点；2011年侦查技能实训中心被评为吉林省实验教学示范中心。